Fw: Reminder Ubuntu 18.04 not supported with Intel MPI
by hpco-dfo-partner-support--ochp-mpo-soutien-au-partenaire@comm.collab.science.gc.ca
Bonjour,
Il s'agit d'un message de rappel pour assurer que l'ensemble des utilisateurs prennent connaissance de la situation avec Ubuntu 18.04.
Ubuntu 18.04 n'étant plus supporté, la nouvelle mise à jour de sécurité de IntelMPI concernant PMIx empêche l'utilisation de la commande srun sur les grappes de calcul Slurm. Puisque la commande srun était toujours utilisée, les administrateurs systèmes ont bloqué l'accès à Ubuntu 18.04.
Si vous souhaitez tout de même utiliser Ubuntu 18.04, vous devez impérativement modifier le profile de site dans le fichier .profile par:
ORDENV_SITE_PROFILE=20230929
Une fois cette modification faite, contactez HPCO pour débloquer votre utilisateur. Un membre de chez HPCO devra vérifier que la modification du site est bien apportée. Il est aussi important que les travaux soient lancés à partir d'un conteneur intéractif ubuntu18.04 afin de respecter les variables d'environnement. Cette nouvelle configuration modifie le comportement de MPI est pourrait causer d'autres problèmes lors de travaux en parallèles.
Nous rappellons qu'il est préférable de passer à des versions de systèmes d'exploitation supportées comme Ubuntu 20.04 et Ubuntu 22.04, dans la mesure du possible.
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Hello,
This is a reminder message to ensure that all users are aware of the situation with Ubuntu 18.04.
As Ubuntu 18.04 is no longer supported, the new IntelMPI security update related to PMIx prevents the use of the "srun" command on Slurm compute clusters. Since the "srun" command was still in use, system administrators have blocked access to Ubuntu 18.04.
If you still wish to use Ubuntu 18.04, you must urgently modify the site profile in the ".profile" file as follows:
ORDENV_SITE_PROFILE=20230929
Once this modification is made, please contact HPCO to unblock your user. A member of the HPCO team will need to verify that the site modification has been applied correctly. It is also important that jobs are launched from an interactive Ubuntu 18.04 container to respect the environment variables. This new configuration changes the behavior of MPI and may cause other issues during parallel jobs.
We remind you that it is advisable to migrate to supported operating system versions such as Ubuntu 20.04 and Ubuntu 22.04 whenever possible.
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