2:31 a.m.
Bonjour,
je fais partie du groupe OPP-MEQ, je travaille avec l'équipe d'acoustique à
l'Institut Maurice-Lamontagne(avec Florian Aulanier et Clément Juif).
J'ai un compte HPC depuis plusieurs années, que je n'ai pratiquement pas utilisé.
Voic quelques infos sur mon compte:
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sgi019@inter-dfo-ubuntu2404:~$ whoami
sgi019
sgi019@inter-dfo-ubuntu2404:~$ groups
dfo_meq dfo dfo_bioios proj_dfo_bioios proj_dfo_meq
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Maintenant, j'essaie de me familiariser avec la plateforme dans le but de lancer des
calculs d'entraînement en apprentissage profond en python.
Je peux me connecter à mon compte sur ubuntu2004/2204/2404. J'ai aussi installé
thinlinc et je peux ainsi me connecter à vis-03.
J'ai fait quelques tests d'exécutions de « job » avec slurm et tout semble bien
fonctionner.
Il semble que mon compte est donc configuré correctement, mais j'ai 2 enjeux pour
l'instant:
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1- SUR UBUNTU2004:
ma variable PATH est vide.
sgi019@inter-dfo-ubuntu2004:~$ echo $PATH
Alors que dans ubuntu 2204 ou 2404, ce n'est pas le cas:
sgi019@inter-dfo-ubuntu2404:~$ echo $PATH
/fs/ssm/main/opt/ssmuse/ssmuse-1.7/ssmuse_1.7_all/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/snap/bin:/opt/thinlinc/bin:/opt/thinlinc/sbin
Résultat, la plupart des commandes de base donnent une erreur:
sgi019@inter-dfo-ubuntu2004:~$ ls
-bash: ls: No such file or directory
sgi019@inter-dfo-ubuntu2004:~$ uname
-bash: uname: No such file or directory
sgi019@inter-dfo-ubuntu2004:~$ ls
-bash: ls: No such file or directory
sgi019@inter-dfo-ubuntu2004:~$ which ls
-bash: which: No such file or directory
sgi019@inter-dfo-ubuntu2004:~$
Je pourrais toujours essayer de définir ma variable PATH moi-même, mais ça me semble pas
la meilleure solution.
Est-ce que cette situation est normale? Est-ce que mon compte est bien configuré sur cette
plateforme?
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2- CHARGEMENT DE ANACONDA OU MINICONDA
J'ai besoin d'utiliser python3, et je voudrais géré mon environnement par conda.
Donc j'aurais besoin de anaconda ou miniconda.
J'ai consulté la page suivante:
https://portal-new.science.gc.ca/xwiki/bin/view/Projects/Science/Software...
On dit:
*****
Availability
Anaconda is available on the following SSM platforms:
All Ubuntu and CentOS images.
******
Mais si j'essaie de charger Anaconda, j'ai une erreur:
sgi019@inter-dfo-ubuntu2204:~/fs7sg/explo$ . ssmuse-sh -x
main/opt/anaconda/anaconda3_2023.09
/usr/bin/env: 'python2': No such file or directory
sgi019@inter-dfo-ubuntu2404:~$ . ssmuse-sh -x main/opt/anaconda/anaconda3_2023.09
/usr/bin/env: 'python2': No such file or directory
python2 ???
Mon collègue Clément Juif m'a dit que Anaconda n'est disponible que sur
ubuntu2004; et que ubuntu2204/2404 n'ont accès qu'à miniconda. Personnellement,
miniconda suffirait, mais je n'ai pas trouvé de documentation là-dessus.
Et pour ubuntu2004, le problème #1(plus haut) m'empêche de faire quoi que ce soit.
Je suis aussi surpris que l'erreur vient de l'absence de python2.
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Voilà, j'espère que vous pourrez me guider face à ces petits problèmes que je
rencontre.
Merci.
Samuel Giard